Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BgnP28653 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BgnP28653 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BgnP28653 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BgnP28653 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BgnP28653 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BgnP28653 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BgnP28653 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BgnP28653 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BgnP28653 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BgnP28653 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms