Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa5P28312 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa5P28312 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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