Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LoxP28301 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LoxP28301 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LoxP28301 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LoxP28301 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LoxP28301 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LoxP28301 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LoxP28301 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms