Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lef1P27782 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lef1P27782 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms