Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CftrP26361 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CftrP26361 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CftrP26361 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CftrP26361 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CftrP26361 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CftrP26361 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CftrP26361 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CftrP26361 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CftrP26361 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CftrP26361 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CftrP26361 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CftrP26361 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CftrP26361 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CftrP26361 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CftrP26361 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CftrP26361 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CftrP26361 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CftrP26361 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CftrP26361 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CftrP26361 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CftrP26361 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CftrP26361 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CftrP26361 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CftrP26361 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CftrP26361 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CftrP26361 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CftrP26361 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CftrP26361 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CftrP26361 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CftrP26361 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CftrP26361 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CftrP26361 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CftrP26361 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CftrP26361 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CftrP26361 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CftrP26361 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CftrP26361 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CftrP26361 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CftrP26361 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CftrP26361 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CftrP26361 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CftrP26361 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CftrP26361 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CftrP26361 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CftrP26361 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CftrP26361 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CftrP26361 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CftrP26361 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CftrP26361 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CftrP26361 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CftrP26361 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CftrP26361 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CftrP26361 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CftrP26361 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CftrP26361 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms