Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctnna1P26231 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctnna1P26231 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms