Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18529 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18529 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18529 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18529 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18529 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18529 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18529 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18529 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms