Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-D1P14427 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-D1P14427 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms