Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApcsP12246 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApcsP12246 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms