Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc6P10629 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc6P10629 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms