Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms