Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1bP0C7A0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms