Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax1P09084 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax1P09084 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms