Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Egr1P08046 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Egr1P08046 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Egr1P08046 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms