Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CfhP06909 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CfhP06909 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CfhP06909 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CfhP06909 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CfhP06909 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CfhP06909 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CfhP06909 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CfhP06909 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CfhP06909 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CfhP06909 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CfhP06909 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CfhP06909 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CfhP06909 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CfhP06909 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CfhP06909 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CfhP06909 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CfhP06909 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CfhP06909 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CfhP06909 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CfhP06909 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CfhP06909 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CfhP06909 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CfhP06909 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CfhP06909 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CfhP06909 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CfhP06909 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CfhP06909 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms