Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ItgamP05555 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ItgamP05555 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgamP05555 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms