Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01789 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01789 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01789 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01789 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01789 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01789 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01789 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01789 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01789 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01789 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01789 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01789 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01789 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01789 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01789 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01789 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01789 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01789 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01789 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01789 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms