Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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