Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp23O88676 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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