Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd7O88665 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd7O88665 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms