Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn2O88552 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn2O88552 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms