Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn20O55082 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn20O55082 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms