Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atp10aO54827 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp10aO54827 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms