Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emp3O35912 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emp3O35912 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emp3O35912 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emp3O35912 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms