Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhx8O35652 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhx8O35652 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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