Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1aO35526 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms