Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nedd9O35177 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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