Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms