Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp955bL7N232 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp955bL7N232 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp955bL7N232 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms