Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4791J3QQ14 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm4791J3QQ14 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm4791J3QQ14 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms