Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms