Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3tc1G3X9F6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc1G3X9F6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms