Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm28038F7BCN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm28038F7BCN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm28038F7BCN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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