Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Rnf165E9QAU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Rnf165E9QAU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rnf165E9QAU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf165E9QAU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rnf165E9QAU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rnf165E9QAU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rnf165E9QAU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rnf165E9QAU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rnf165E9QAU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf165E9QAU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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