Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdhr2E9Q7P9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms