Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms