Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms