Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms