Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcom1E9PZ54 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcom1E9PZ54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms