Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3lE9PWZ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3lE9PWZ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms