Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30dE9PWL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms