Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc175E9PVB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc175E9PVB3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.4 ms