Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wscd2D4PHA7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wscd2D4PHA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wscd2D4PHA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms