Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc5C3VPR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrc5C3VPR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms