Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf3B2RUQ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms