Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC10BA6NIK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms