Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34dA2AGU5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms