Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb4A2A863 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb4A2A863 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms