Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc173A0JLY1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc173A0JLY1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms