Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms